虽然风格巨变，但是《织梦岛》凭借着出色的质量，依旧是俘获了玩家们的心。因此任天堂也在1998年的GameBoyColor上推出了彩色版的《织梦岛DX》来满足玩家。DX版本不只是从黑白变成彩色，还对游戏做了优化，并且增加了一些游戏时长。两个版本在全球的合计销量也超过了600万份，被列入史上最最佳游戏的榜单中（2019年在Switch上也发布了重制版）。
05《塞尔达传说：时之笛》
1998，任天堂在自家的游戏机N64上推出了塞尔达传说的新作《时之笛》，这是一款被多个游戏媒体评为满分，并且被誉为神作的游戏。《时之笛》是第一款使用3D技术的塞尔达系列作品，此作的画质和玩法，搭配N64强大的性能，在当时可以说是史无前例的牛逼。
游戏讲述林克小时候被一棵守护神迪古树，安排了一只精灵作为林克的守护精灵，同时也委托了林克一个非常重要的使命，随后林克便展开了他的冒险旅程。就如游戏名一样，林克可以在游戏中吹奏笛子，就能触发穿越时空的特殊能力。玩家们可以使用这项能力，在林克幼年与青年时期来回穿梭，以此解谜通关。
《时之笛》也第一次采用了Z瞄准系统，也就是可以把视线集中在单位敌人身上，让玩家们拥有更好的操控空间。由于玩法创新多样，《时之笛》被当时使得各大媒体常年评价为最佳游戏，同时也在当时成为了塞尔达系列中卖得最好的作品。现今在全球的累积销量760万份，成为了塞尔达系列中最重要的里程碑之一。
06《塞尔达传说：梅祖拉的假面》
在2000年的时候，任天堂也在N64上推出了《时之笛》的续作《梅祖拉的假面》。游戏的剧情沿用了很多前代《时之笛》的内容，大概讲述林克在一次错位时空交换时，不小心跌进了一个即将在三天后毁灭的世界。在有限的时间里，林克需要找到方法来防止世界被毁灭。
这部作品很考验玩家们的思维能力和想象力，游戏也采用了较为阴暗的风格，给人一种末日的感觉，所以被誉为难度高且最为诡异的塞尔达系列作。《梅祖拉的假面》最大的特点就是采用了面具系统，每个在游戏里的面具都具有其独特的能力，还能让林克转变成各种异族形态。
游戏在日本发行的第一周就卖出了30份，现今全球的销量也达到了336万份，销量和前几代相比有些差距。
07《塞尔达传说：不可思议的果实》
2001年，任天堂和卡普空联手打造出了《塞尔达传说：不可思议的果实》，并在GameBoyColor上推出。和以往有些不一样的《不可思议的果实》是双版本独立发售的游戏，也就是《大地之章》和《天空之章》这两部作品的剧情都有所差异。
但《不可思议的果实》最独特的地方就在于两者之间的联动，玩家们只要在任意一个版本通关后，就会获得一组密码，而将这组密码输入到另外一个版本的游戏中，开启新游戏时就会产生新联动剧情和特殊道具等等。而也只有透过联动才能体验到完整的主线剧情。这种新奇的游玩方式，也让《不可思议的果实》总销量达到了396万份。
08《塞尔达传说：风之杖》
2002年末，任天堂再次推出了一部满分作品《风之杖》。既任天堂推出了新一代主机NGC之后，《风之杖》是第一款在NGC上出现的塞尔达系列作。此作采用了卡通渲染的技术，所以看起来比较喜感，据说是宫本茂为了要让塞尔达系列全年龄化，才做出的决定。
而《风之杖》虽然还是一样采用了航海系统，但却增加了使用帆让船高速运行的玩法，这样玩家们就可以省下更多时间，不会在跑图过程中感到无聊，而且还能在船上利用钩子勾宝物等等。《风之杖》现今累计总销量达到了443万份，比起上一代小有进步。
09《塞尔达传说：黄昏公主》
2006年，任天堂推出了万众瞩目的Wii游戏主机，而原本预计要在NGC推出的新作，也因为突如其来的新主机，而产生了Wii版和NGC版两个版本。这部新作就是《塞尔达传说：黄昏公主》，也是第一部采用了3D写实风格的塞尔达系列作。
《黄昏公主》中的迷宫都设计得非常大，游戏时长在系列中名列前茅。《黄昏公主》最大的特点就是在Wii版本上采用了全新的体感操作，玩家们可以使用Wii的手柄挥动林克手上的剑与操控弓箭等等。由于考虑到大部分玩家都是右撇子，任天堂也在Wii版本中将原本左撇子的林克改成了右撇子，而NGC版本则依旧保持不变。
《黄昏公主》也是第一款能骑马的塞尔达系列作，而且林克还有了能够变成狼的能力。独特的玩法、创新的设计风格，让这款作品的销量超越了系列中卖得最好的《时之笛》，全球累计销量达到了885万份，成为了当时塞尔达系列销售量的榜首。
之后任天堂也在Wii、DS以及NDS上推出了各种塞尔达系列游戏，但考虑到篇幅的关系，我就不展开来讲了。
10《塞尔达传说：旷野之息》
终于到了2017年，万众瞩目的Switch推出了，但令塞尔达的粉丝更为兴奋的是《塞尔达传说：旷野之息》这部新作将会在Wiiu和Switch上推出。
《旷野之息》一发售就广受好评，各大媒体更是清一色好评，并且获得了最佳动作冒险游戏、最佳游戏开发、卓越游戏设计等一大堆奖项，并且夺下了“2017年度游戏”的桂冠。至于游戏的故事剧情，依旧是简单的打败魔王、拯救公主。
《旷野之息》的自由度、战斗系统、解谜元素通通都做得很到位。游戏也藏着非常多的细节，比如在打雷的时候，拿着金属制品会被雷劈、下雨时攀登会往下滑等等。另外武器方面也会有耐久度，耐久度归零，武器就会消失。还有其他太多太多的细节，完全无法一言以蔽之。
这部神作，截至现在两个版本累计销量2400万份，再次突破了《塞尔达传说》系列的最佳销售记录。而任天堂也宣布了《旷野之息》的续作正在在开发当中，真的是非常非常然人期待啊！
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