首都医科大学宣武医院副院长卢洁教授:AI在脑脱髓鞘病MRI中,有哪些应用?|CMAI 2022


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首都医科大学宣武医院副院长卢洁教授:AI在脑脱髓鞘病MRI中,有哪些应用?|CMAI 2022

影像组学是在大数据和人工智能的背景下产生的精准影像分析技术,能挖掘肉眼无法识别的高维定量特征。运用高级数学模型算法转化为具有高分辨率可重复、低冗余可挖掘的高维数据,对特征进行量化分析,从而深入探讨图像中包含的潜在信息。

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这是具体的影像组学工作流程图,从图像采集与分割,到深度特征、语义特征、形态特征及纹理特征的提取,再到进行特征筛选与模型构建。特征筛选和建模均有很多方法可供选择。

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我们来看一下组学列线图,它是建立在多因素回归分析的基础上,将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,按照一定比例绘制在同一平面上,从而用来表达预测模型中各个变量之间的相互关系。

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在脑脱髓鞘病MRI成像人工智能应用研究中,我们收集到150例患者,其中73例为多发性硬化,77例为视神经脊髓炎。我们以68例患者作为训练集,62例作为验证集,手动勾画病灶,基于组学列线图在T2WI图像的病灶中提取了273个定量组学特征。

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最终筛选出11个组学特征和4个临床特征,可以看到训练集AUC和测试集AUC是比较接近的。

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另外一个课题对189例的患者进行了研究,其中95例是多发性硬化,94例是视神经脊髓炎,其中以135例患者作为训练集,54例作为验证集,手动勾画病灶之后,同样基于组学列线图,在颈髓T2WI图像显示的病灶中提取了485定量组学特征。

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最终筛选出9个组学特征与5个临床特征纳入模型,其鉴别效能较高。

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人工智能辅助鉴别诊断同样具有挑战性,主要在于基于单一的临床数据库、基于单一序列、基于单一磁共振仪,组学列线图仍缺乏可解释性,且缺乏人工智能模型和临床医生判读的对比。

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宣武医院收集了116例脑脱髓鞘病患者,其中78例为MS,38例为NMO,包含两个数据集,既有1.5T又有3T。我们收集了T1-MPRAGE和T2WI两个序列的影像数据,以及患者的残疾程度评分、病程等临床信息。

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我们从T2病灶中提取了1118个定量的组学特征,基于多参数影像表征,构建了随机森林分类模型,将筛选出的9个组学特征和4个临床特征筛选出来纳入模型。

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并且对比了神经影像医生阅片诊断和影像组学模型诊断的正确率。医生的鉴别结果准确率为0.709,敏感性为0.615,特异性为0.750。机器学习模型鉴别结果的准确率、敏感性、特异性都有明显提高,优于医生肉眼鉴别的结果。

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机器学习模型由高维的组学特征组成,所以其解释性相对来说比较差,不容易理解。SHAP是目前比较流行的一种模型解释方法,通过计算在合作中每个个体的贡献来确定个体的重要程度。本模型具有可解释性,对于case A,随机森林模型判断有89%可能性是MS,其中最主要的贡献来自H-MPR-Log_95这个特征,我们可以把每一个特征的贡献值计算出来。

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拓扑就是把实体抽象成与其大小、形状无关的“点”,而把连接实体的线路抽象成“线”,进而以图的形式来表示这些点与线之间关系的方法,目的在于研究这些点、线之间的相连关系。拓扑结构图就是表示点和线之间关系的图,拓扑可以应用在分子结构、地理图、DNA结构和绳结等。

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我们也可以将拓扑在脑脱髓鞘疾病的诊断中进行应用。由于MS和NMO两种疾病的发病机制不同,其脑内病灶的空间分布不同,形态、大小也不相同,所以这两种疾病的脑内病灶的拓扑性质并不相同,我们希望能够找到潜在的鉴别诊断突破点。

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我们对97例脱髓鞘病例的T2WI数据进行了分析,其中66例MS,31例NMO。这部分数据的结果我们目前还没有发表。具体通过软件勾画病灶,提取MS多发病灶的空间模式。整个DTA的框架是由三个模块组成的,动态层次网络构建、动态拓扑量化以及拓扑模式分析。

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我们看到鉴别诊断的拓扑研究结果,与MS患者脑内病灶比较,NMO患者的病灶连接更加紧密,而且病灶的体积更大。拓扑研究具有很多优点,模型和结果可视化、病灶网络连接可视化、病灶体积可视化。

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和以往的鉴别诊断模型比较,拓扑模型具有更高的AUC,达到0.875,准确性和特异性也很高。

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以前的文献报道中,MS磁共振预测研究的准确率大约为58%~70%,其临床表现和影像学的征象通常不匹配,磁共振的病灶缺乏特异性,T2WI和T1WI上病灶的病理特征也缺乏特异性。

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所以我们是不是可以通过基于拓扑的人工智能模型来帮助预测预后。

通过磁共振纵向随访研究发现,慢性病灶具有融合的趋势,而且临床的残疾程度会逐渐增加。所以我们提出假设随着疾病的进展,病灶的拓扑性质发生改变;反之,病灶拓扑结构变化也具有潜在的预测作用。

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这部分研究共收集了90例进展的MS和54例非进展MS,如果残疾量表增高1.5分以上就定义为进展,小于1.5分定义为非进展,用T2WI数据进行训练。通过对病灶进行勾画提取多发病灶的空间模式。

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结果显示,和非进展的患者相比,进展的MS患者具有更密集的病灶连接,而且病灶的病变体积更大。同时也实现了模型及结果可视化、病灶3D可视化、病灶网络连接可视化和病灶体积可视化。

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和既往的研究报道相比,磁共振预测模型同样显示了更高的AUC,达到了0.752,准确性、特异性也较高。

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