本文摘自科技资料库,侵删。

文/刘沐芸 中国(深圳)综合开发研究院特约研究员、个体化细胞治疗技术国家地方联合工程实验室主任
近期,南非科学家测序发现了一种新变异的新冠病毒,该变异病毒出现一种新组合,显示出更高的传染性和能突破免疫防护的致病性,因而引发业界关注与忧虑。该新变种病毒的学名为B.1.1.529,被世界卫生组织(WHO)命名为Omicron(希腊字母第15字)。那这个病毒到底是什么?有什么特征?虽然,目前关于此变种病毒的已知信息远远少于未知信息,但我们在此根据已有研究进行梳理,与大家分享。
Omicron的首报告地
本周一(2021年11月22日),南非科学家首次发现并报告了这个病毒谱系,因而“拉响警报”。随后,博茨瓦纳和中国香港也陆续报告了该病毒谱系,接着,比利时和以色列也确诊了新变种病毒感染患者。并且,针对SARS-CoV-2的常规PCR检测不易检测到关键标靶S基因,此种检测“失灵”现象也曾发生于Alpha变种病毒。
虽然,是南非科学家首先发现并报道该新变种病毒,但其原发地仍尚未明确,目前依据对变种病毒的基因序列推测,可能是南非,或博茨瓦纳,测序显示这两地的病毒基因序列具有强相关性。
因此,本周五(2021年11月26日)下午,美国新增了对这两个国家的入境限制,该禁制令将于下周一生效。

变种那么多(已排到15),为何这个“独获”关注?
首先,这个变种病毒在南非的系列“变种赛跑”中“跑赢”胜出,甚至“跑赢”了“上届冠军——Delta”,而且速度“更快”。目前,该变种病毒已经“驱动”了南非新增感染病例的上升,并引发明显的“波幅”,显示其更强的“传染能力”,甚至是对疫苗接种者的传播力也未见减弱,似乎是结合了Delta的特征。

//Omicron(B.1.1.529)的传播力远超Beta和Delta变异毒株,它没有后两者刚爆发时的缓冲阶段,一经发现确诊数即飙升。
再一个就是,该病毒变异非常罕见。此新出现的变种病毒呈现一种非常“特别”的“突变组合”,同时具备2种特征,集合了“传染性”与“致病性”(其突破人体免疫屏障的能力增强)。
目前,科学家还无法预测,同时兼具这2种“特性”的突变病毒的进化轨迹。但让科学家担忧的是,这个新变种病毒的刺突蛋白发生了32处变异,且这些变异针对的,正是疫苗对人体免疫系统识别新冠病毒的“训练”位点。也就是,专门针对新冠疫苗帮助人体建立的“新冠防御系统”。
这一变异特征意味着什么呢?
如果病毒的刺突蛋白发生改变,首当其冲的可能就是,通过疫苗接种、或曾经感染获得的抗体无法识别“新变异病毒”的入侵。这也体现出其传染性增强的蛋白特征。
疫苗接种,通过引发一种多克隆反应,由此产生能识别不同刺突蛋白的多重抗体组合,形成人体免疫力。迄今为止,其他变种病毒的突变多发生在刺突蛋白特定抗原位点,虽然会“躲过”一些抗体的识别,但仍然无法“逃过”其他抗体的识别与“狙击”。因此,其他的很多突变并没能引发新的流行,也未获得更多关注。

//Omicron 的刺突蛋白具有红色、蓝色、金色和黑色的新突变。图片:格拉斯哥大学病毒研究中心
但,Omicron就不同了。据英国一项研究,几乎我们已知的刺突蛋白上所有位点都发生了改变。但是否这就意味着现有疫苗的防御失效呢?该研究的作者表示,需要更多的研究才能给出确定的回答。至目前,该变种病毒对疫苗效用的影响还无法判断。可能存在一定的免疫逃逸,但逃逸的程度目前仍无法准确衡量。过去的变种(希腊字母的1-14)病毒也出现过不同程度的“免疫逃逸”,但总体上,疫苗仍表现有效的保护作用。
也因此,每当有新变种病毒出现时,科学家首先考虑的就是,疫苗是否仍然有效?当然,除了疫苗的疗效顾虑,还有就是目前已经证实有效的治疗药物的疗效是否会受到新变种病毒的影响,以及影响的程度等等。
这么多的突变是怎么形成的?
依据此新变种病毒的变异速度,科学家推测,这个新变种可能不是来源于一般的Covid-19患者。因为,大多数人都是急性感染,患者在感染后都能快速清除病毒。但可能会有一些“免疫低下”患者期间发生了慢性Covid-19,由此引发新冠病毒在这些免疫低下的患者体内“长期滞留”,为更好的适用宿主环境,以一定的速度积累突变,实现“量变到质变”的进化,而这些“病毒行为”在急性感染中不会出现,也没有机会发生。
并且,从病毒序列来看,Omicron并不是Delta的后代,当Delta流行全球时,科学家就发生预警,未来可能会出现Delta因“机会突变”而形成的新“溢出”变种,而这个新“溢出”变种可能就是Omicron。
接下来会发生什么?
对Covid-19流行病学的影响。从目前的追踪研究来看,自发现以来,该变种病毒在南非引发的相关病例数总体还不是特别高,因此有可能会是超级传播的局部事件。但具体对全球疫情局势的影响,还需进一步的病例追踪研究。
下一步,需要科学家在实验室研究,看已有疫苗产生的抗体,或曾经感染获得的抗体,是否仍然能识别并中和这个新出现的变种病毒。还有就是,该变种病毒引发感染的重症率情况,重症率是高了?还是低了?还是相对稳定?
对全球疫情局势的影响。这个目前不好判断。从过去近2年的疫情情况来看,新冠病毒发生过多次变异,但只有少数引发了全球流行,如Delta和Gamma。其他大多数变异多表现为地域散发。
疫苗接种的全球可及性
从病毒进化“机会突变”这一特征来看,只要有人感染,病毒就有了变异、进化的机遇期。

此次变种病毒首先在南非被发现,是否让我们再次意识到“全球疫苗接种公平可及”的重要性?全球化的今天发生疫情大流行时,“没有一处是安全的,除非每个地方都安全”将是一个新的大流行特征。目前在南非,每4个人中只有一个人接种了新冠疫苗。因此,疫苗接种的全球可及性,是一个必须要面对和解决的问题。
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