本文摘自PHP中文网，作者V，侵删。
首先我们需要了解四个参数：
1 2 3 4 | slow_query_log # 是否开启慢查询日志，默认OFF，开启则设置为 ON。
slow_query_log_file # 慢查询日志文件存储位置。
log_queries_not_using_indexes # 是否把没有使用到索引的SQL记录到日志中，默认OFF，开启则设置为 ON。
long_query_time # 超过多少秒的查询才会记录到日志中，注意单位是秒。
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然后执行语句设置（这个方法重启MySQL后会失效）
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知道参数含义后，我们就可以直接设置我们需要的参数了，我这里使用的是全局设置。
1 2 3 4 | SET GLOBAL slow_query_log = 'ON';
SET GLOBAL slow_query_log_file = '文件路径（绝对路径）';
SET GLOBAL log_queries_not_using_indexes = 'ON';
SET GLOBAL long_query_time = 1; # 这里需要注意下，long_query_time参数设置后需要下次会话后才生效，当前会话查询还是原来的数值
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最后修改配置文件（永久设置）
如果想重启MySQL后不失效，可以修改MySQL配置文件。在配置文件中添加以下语句：
1 2 3 4 | slow_query_log="ON"
slow_query_log_file="文件路径（绝对路径）"
log_queries_not_using_indexes="ON"
long_query_time=1
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重启后即可生效。
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